Kết Quả
MolNetEnhancer cung cấp thông tin phân loại hóa chất của năm gia đình phổ mà tóm tắt mạng phân tử các hợp chất liên quan đến chiết xuất từ lá, thân và rễ của cây rau răm. Vì vậy, kết quả của chúng tôi cho phép chúng tôi khẳng định rằng chúng tôi đã tìm thấy các nhóm phân tử gồm C-glycosyl flavonoids, hợp chất phenolic, hợp chất heterocyclic, alkaloid, benzodioxol và dẫn xuất của amide béo, như được thể hiện trong Hình 1B.
Để đảm bảo với quá trình đánh dấu hợp chất, chúng tôi đã sử dụng Sirius 4 [35] kết hợp với hệ thống phân loại CANOPUS [36]. Bên cạnh đó, chúng tôi đã sử dụng các đặc điểm phân loại thuộc họ của chi Peperomia để tăng cường sự tin tưởng cho quá trình đánh dấu hợp chất. Sau đó, quá trình dereplication đã được thực hiện, cho phép đánh dấu 12 hợp chất (1, 2, 5, 6, 7, 9, 10, 11, 13, 14, 15, và 16), được miêu tả lần đầu tiên trong loài này. Hình 1B đã làm nổi bật hai ví dụ thuộc nhóm benzodioxol. Hợp chất guineensine (384.2566 m/z) và pipercallosidine (304.1904 m/z) đã được đánh dấu trong thư viện GNPS, đã từng được báo cáo trong họ Piperaceae [37].
Để làm rõ hơn về mô phỏng dữ liệu phổ MS2 trong GNPS của hợp chất guineensine, bảng 1 hiển thị thông tin về hợp chất. Ví dụ, guineensine có thể được mô tả chủ yếu bằng các ion sản phẩm có m/z 311, 283, 175, 161, 135, 123 và 102 [38]. Các mảnh vỡ 311 m/z có thể là kết quả của việc mất nhóm N-isobutyl, và mảnh vỡ 283 m/z là kết quả của việc mất N-isobutylformamide. Các mảnh vỡ 175 và 161 có thể là kết quả của phân mảnh hợp chất dẫn xuất alkyl, theo sau là phân mảnh tương tự tại vị trí n1 của chuỗi alkyl (135 m/z) [37]. Hai mảnh vỡ cuối cùng [M + H]+ là chung cho tất cả các hợp chất thuộc nhóm benzodioxol và chúng xác định nhóm benzodioxol (123 m/z) và N-isobutylformamide (102 m/z). Hợp chất pipercallosidine đã được báo cáo trong họ Piperaceae [39] và nó đã được xác định bằng các ion sản phẩm có m/z 231, 213, 187, 173, 159, 135, 123, 111 và 102. Các mảnh vỡ chung xảy ra cho hợp chất này, ví dụ như mất nhóm N-isobutyl (231 m/z), phân mảnh n1 (135 m/z), nhóm benzodioxol (123 m/z) và N-isobutylformamide (102 m/z).
Thông qua sự tương ứng thực nghiệm trong GNPS với guineensine, hợp chất ([M + H]+ có m/z 356.2216, C22H29NO3) được đặt tên là retrofractamide B. Các mảnh vỡ có m/z 175, 161, 135, 123 và 102 đủ để xếp hạng ứng cử viên chính. Dữ liệu từ loài Piper nigrum đã xác nhận việc phát hiện trong P. pellucida [40]. Iôn [M + H]+ có m/z 332.2249 và công thức phân tử C20H29NO3, đã được báo cáo trong Piper nigrum [41], và ở đây, nó được đặt tên là dehydroretrofractamide C (ion chất phụ chính có m/z 173, 161, 135, 123 và 102).
Sự chia rẽ glycoside theo cơ chế 0,4X1, 0,3X1 và 0,2X1 là cơ chế chính (xem Hình 2) để phân loại C-glycosyl flavonoids. Ví dụ, hợp chất 2 và 3 có [M + H]+ có m/z 611.1584 và 565.1524 đã được đánh dấu là luteolin-6-C-glucoside-8-C-arabinoside và isoschaftoside. Isoschaftoside được đặc trưng dựa trên sự tương quan về phổ trên GNPS, xem xét tất cả các mảnh vỡ được hiển thị trong Bảng 1 và cũng đã xác nhận mất một phần của hexose (xem Hình 2) đối với các mảnh vỡ có m/z 469 (0,4X1), 439 (0,3X1) và 379 (0,2X1) từ ion có m/z 499. Hợp chất 3 đã được báo cáo trước đó bởi nhóm của chúng tôi trong P. Pellucida [42] và các mảnh vỡ hexose tương tự đã được quan sát đối với các ion sản phẩm có m/z 455 (0,4X1), 425 (0,3X1) và 395 (0,2X1) có thể là kết quả từ 515 m/z. Nhóm flavonoids có thể được nhìn thấy trong hình 3.
Đối với các dẫn xuất benzene, đỉnh 8 có m/z 387.1773 đã được cô lập và báo cáo trong các báo cáo trước đó của chúng tôi [42]. Hơn nữa, chúng tôi dự đoán cấu trúc tương tự (xem Hình 3) bằng cách sử dụng SIRIUS và đó là pellucidin B trimethoxy-substituted, một dimeric ArC2 [43]. Cho đến hiện tại, không có dữ liệu về sự chia rẽ trong văn bản về cấu trúc đó, nhưng có thể giải thích chủ yếu bằng các ion sản phẩm có m/z 219 và 169. Sự chia rẽ giữa vòng thơm và nhóm dihydronaphthalene giải thích các ion sản phẩm có m/z 169 và 219 m/z. Đỉnh 10 đã được chú thích là 5-methoxy-2-methyl-2,3,8,9-tetrahydrofuro [2,3-h]chromen-4-one và được miêu tả lần đầu tiên trong P. pellucida.
Ngoài Isoschaftoside và Pellucidin B, các hợp chất khác như Liolide và Pellucidin A đã được báo cáo cho loài này [42,43]. Những hợp chất khác như vidarabine (1) [44], N-methylcorydaldine (5), 2′,4′,5′-trihydroxybutyrophenone (6), 2,6-di-tert-butyl-4-hydroxymethylphenol (7), velutin (9) và brachystamide B (16) đang được nhóm của chúng tôi báo cáo lần đầu tiên cho loài này sau quá trình xem xét nhiều lần [7,18,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54].
